Okay alors j'avais trouvé un truc sur le net mais c'est franchement compliqué; je vais essayer de faire simple et si c'est pas très clair, n'hésitez pas hein... (s'il y a un spécialiste de la bioch sur ce forum, qu'il me complète car je suis loin d'être au taquet):
-la molécule énergétique qui est utilisée par l'organisme, c'est l'ATP (adénosine triphosphate) qui va être produite à partir des macronutriments(glucides, lipides et protéines) via différentes voies: il s'agit du cycle de krebs pour les lipides par exemple, etc...
-concernant l'adaptation au jeûne (et là il a fallu que j'aille regarder ce qu'était ce fameux régime Atkins

), j'espère que ça ne sera pas trop du plaggiat de mon bouquin...
On distingue 4 phases:
-Phase 1 dite post-absorptive (quelques heures entre 2 prises alimentaires): il y a apport de glucides entre autres qui va stimuler la sécrétion d'insuline; or l'insuline est une hormone qui agit à la fois sur le métabolisme des glucides et de lipides. Elle va stimuler l'utilisation préférentielle du glucose comme substrat énergétique et également son stockage sous forme de glycogène dans le foie(glycogénogénèse) et favoriser le stockage des lipides (=lipogénèse). Puis au fur et à mesure que le taux de sucre dans le sang va diminuer, parallèlement, l'insuline va être de moins en moins sécrétée et il va y avoir donc les effets inverses: utilisation du glycogène, utilisation préférentielle des lipides comme substrat énergétique (=lipolyse)
--> en gros, durant cette phase, utilisation du glucose+++
-Phase 2 adaptative (de 1 à 3 jours): le glycogène hépatique est épuisé et donc le glucose va être produit à partir des protéines du muscle(=néoglucogénèse) pour les tissus qui ont absolument besoin de ce substrat pour produire de l'énergie (cellules sanguines, rein, mais surtout cerveau...) et une autre partie de l'énergie va être produite à partir des lipides
-->phase 2: utilisation protéines musculaires et lipides
-Phase 3: jeûne prolongé (plusieurs mois selon les réserves lipidiques): là, l'organisme s'adapte de façon spectaculaire, on observe une épargne protéique et énergétique globale. Le cerveau va utiliser des produits des lipides pour "avoir son énergie" (t'es quand même pas frais à ce niveau-là!!!), on observe donc une grande augmentation de l'utilisation des lipides durant cette phase, jusqu'à ce qu'ils soient épuisés en fait.
-->phase 3: utilisation des lipides
-Phase 4 dite terminale: y a plus de gras, y a plus de sucre alors l'organisme va utiliser les protéines pour produire de l'énergie et va s'attaquer à ce qu'on appelle les protéines essentielles (membranes cellulaires, etc...), des signes de carence vont apparaître puis le DC quand une trop grande part de ces protéines aura été utilisée
-->phase 4: utilisation des protéines essentielles jusqu'à ce que mort s'ensuive...
Voilà, j'espère que c'était assez clair, bonne soirée et enjoy.