A voir la vie (plutôt rustique) que vivent ces gens, je ne pense pas qu'ils bénéficient pour autant de matériel vraiment spécifique pour faire ça 
En tous cas, merci car votre précision permet de répondre clairement à une question : ce mode de filtration (quel que soit le "protocole" d'utilisation des écailles) ne permet pas l'élimination des bactéries, virus et autre réjouissances 
J'ai regardé l'émission.

Pour la seconde partie de ta question. Eliminer les contaminations "biologiques" n'est pas un problème quand on est en camp fixe.
Pour une communauté : Il existe énormément de méthode mettant en oeuvre la décantation, le brassage, la floculation et la filtration qui sont assez rustiques à mettre en oeuvre mais nécessitent de grandes surfaces. On peut alors finir par une décontamination chimique, la plus simple étant avec de "l'eau de javel" dont on maitrise la synthèse depuis le XVIIIème siècle.
Encore moins difficile dans cette environnement pour une petite communauté (haute altitude, ensoleillement) il suffit de mettre en œuvre la méthode SODIS ou un dérivé. Quasiment gratuit, pratique facile à mettre en oeuvre tant que l'on n'a pas besoin de grandes quantité d'eau.
C'est autrement plus difficile d'éliminer les sels ou les pollutions chimiques aux métaux lourds. D'autant plus que c'est parfois nécessaire pour l'eau d'irrigation des cultures (couts ++). Les liens ci-dessus décrivent des méthodes plus ou moins énergivores et/ou difficile à mettre en œuvre, mais généralement réservées à la consommation humaine (moindre quantité).